U všech pacientů před zahájením poskytování zdravotní péče Ministerstvo zdravotnictví doporučuje provádění screeningového vyšetření na přítomnost klinických příznaků covid-19 a určit tzv. epidemiologickou anamnézu se zaměřením na pobyt v oblastech s vysokým nebo narůstajícím počtem osob s onemocněním covid-19 nebo v případě úzkého kontaktu s osobou, která koronavirem onemocněla.

Testování na covid-19 není vzhledem ke stávající epidemiologické situaci považováno za nezbytnou součást předoperačního vyšetření všech pacientů. Testování bezpříznakových pacientů před zahájením zdravotní péče se doporučuje pouze v situacích, kdy pacient přichází z rizikové oblasti (ohniska nákazy) nebo se jedná o pacienta s klinicky závažnými rizikovými faktory, které by mohly v případě klinického rozvoje nákazy covid-19 nepříznivě ovlivnit konečný výsledek poskytované zdravotní péče.

Zároveň ministerstvo vydává aktualizaci algoritmu testování na přítomnost covid-19 k ukončení karantény, dále algoritmus k testování bezpříznakových osob a algoritmus testování pacientů s klinicky závažnými rizikovými faktory. Ministerstvo zdravotnictví také s účinností od 8. června 2020 ukončuje povinné testování zaměstnanců sociálních služeb rychlotesty.

Při testování na covid-19 k ukončení karantény se bude test provádět pouze PCR metodou. Kritéria ukončení 14denní karantény u osob, kterým byla nařízena karanténa z důvodu úzkého kontaktu s osobou, která onemocněla covid-19, je po uplynutí této doby nepřítomnost klinických známek onemocnění a negativní PCR test.
Vzhledem ke stávající epidemiologické situaci Ministerstvo zdravotnictví doporučuje přechod od plošného vyšetřování k cílenému vyšetřování v ohniscích nákazy.