Od 1. ledna 2023 zanikly funkce náměstků pro řízení sekcí, z nichž se podle novely zákona stali vrchní ředitelé sekcí. Tato změna se týká sekce ekonomické, sekce majetkové, sekce obranné politiky a strategie, sekce průmyslové spolupráce a sekce vyzbrojování a akvizic.

Nově je tedy paní Blanka Cupáková vrchní ředitelkou sekce ekonomické MO, pan Filip Říha vrchním ředitelem sekce majetkové, pan Jan Jireš vrchním ředitelem sekce obranné politiky a strategie, pan Lubor Koudelka vrchním ředitelem sekce vyzbrojování a akvizic. Vrchní ředitelkou sekce průmyslové spolupráce se od 1. ledna 2023 stala paní Radka Konderlová. V organizační struktuře resortu došlo spolu s ukončením pozic odborných náměstků též ke zrušení jejich kanceláří.

Aktuální změny v organizačním řádu Ministerstva obrany ČR se netýkají funkcí náměstků člena vlády, tedy 1. náměstka ministryně obrany, jímž je pan František Šulc, a náměstka ministryně obrany pana Daniela Blažkovce.