Cílem budování a modernizace přestupních teminálů je zatraktivnění veřejné dopravy a zvýšení bezpečnosti, a tím zvýšení počtu cestujících využívajících veřejnou dopravu. Jak název uvádí, jedná se o přestupní terminály mezi různými druhy dopravy, většinou se jedná o autobusová nádraží či nástupiště, která jsou v blízkosti vlakových nádraží. IROP přispívá na modernizaci nebo výstavbu budov terminálů a jejich vnitřní vybavení, budování nástupišť, vytváření parkovacích míst pro auta a kola. Často se jedná o velké investice nad finanční možnosti měst či krajů, proto podpora z IROP představuje skvělou možnost, jak získat prostředky na zlepšení podmínek pro cestující ve veřejné dopravě.

Jedna z největších investičních akcí podporovaných ze zdrojů IROP je terminál a parkovací dům v Benešově. Před rekonstrukcí situace ve městě neodpovídala požadavkům současnosti. Autobusy stály prakticky v centru města, přičemž tudy denně projelo 248 autobusových spojů a dalších 104 vlakových. Vzhledem k blízkosti hlavního města přitom Benešov představuje důležitý přestupní uzel, který ročně využívají téměř dva miliony cestujících.